Лаборатория геномных и постгеномных технологий и генетического контроля

Основные направления научной-исследовательской работы

1.    Поисковые исследования генетических мутаций, которые лежат в основе патогенеза заболеваний;

2.    Изучение генетического полиморфизма ферментов, вовлечённых в процессы транспорта и метаболизма, прогнозирование межлекарственных взаимодействий.

3.    Изучение геномных аспектов диагностики и лечения онкогематологических заболеваний.

4.    Изучение молекулярных механизмов цитотоксического и канцерогенного эффекта молекул-кандидатов.

5.    Изучение существующих и поиск новых фармакогеномных маркёров эффективности и безопасности лекарственных средств.

6.    Разработка и оптимизация процедуры аутологичной трансплантации стволовых клеток крови в терапии онкогематологических заболеваний у пациентов, проживающих на территории Волгоградской области.

Технологии и парк оборудования

В лаборатории фармакогеномных исследований и генетического контроля

доступны все ключевые технологии молекулярно-биологического и клеточного анализа, начиная от рутинного иммуноферментного анализа до полногеномного секвенированиянового поколения:

·      ПЦР в реальном времени;

·      двумерный (2D) электрофорез;

·      иммуноферментный анализ (ELISA);

·      вестерн-блоттинг;

·      проточная цитометрия;

·      полногеномное секвенирование NGS.

Парк ключевого оборудования лаборатории включает следующие позиции:

·         Система для проведения цифровой количественной амплификации нуклеиновых кислот QX100, Bio-Rad, США c комплектом оборудования для системы QX100, BioRad 1863001 компл 2, Bio-Rad, США;

·         Высокопроизводительная система на основе метода ПЦР для синтеза целевых участков ДНК Access Array, Fluidigm, США;

·         Детектирующий ДНК-амплификатор для проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией накопления продуктов ПЦР в процессе амплификации в реальном времени (ДНК-Амплификатор CFX96 Touch Real Time System c ПО CFX Manager на русском языке, комплект, BioRad, США);

·         Центрифуга Avanti JXN-26 для осаждения нуклеиновых кислот;

·         Система для высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот ДНК lon Personal Genome Machine®(PGM™), Applied Biosystems, США

·         Система очистки воды комбинированная Milli-Q Direct-Q;

·         Аппарат для аналитического изоэлектрофокусиования на стрипах и разделения белков на с иммобилизованным (фиксированным) градиентом рН (Система для изоэлектрофокусировки (2D-электрофорез) IEF PROTEAN® i12™ IEF, комплект, Bio-Rad, США);

·         Система для электроблоттинга (Система для блоттинга Trans-Blot Turbo, электроблоттинг, на две кассеты, со старт. набором, Bio-Rad, США);

·         Система документирования и анализа результатов 1- и 2-D электрофореза, вестерн-, нозерн- и саузерн-блоттинга ChemiDoc™Touch Imaging Syste с программным обеспечением Image Lab™Touch, субстратом Clarity™ и стандартами Precision Plus Protein™Dual Color.

Регламентация научно-исследовательской деятельности

Международные подходы к созданию инновационных биологических, в том числе, генотерапевтических препаратов, диктуют необходимость применения наиболее информативных и высокотехнологичных научно-исследовательских технологий (геномных, протеомных) и оборудования, в оценке их качества, эффективности и безопасности применения (иммуногенного и канцерогенного потенциала) в соответствии с требования надлежащей лабораторной практики, что отражено в действующих национальных нормативных документах, а также руководствах Евразийской экономической комиссии, принятых в рамках создания единого рынка лекарственных средств ЕАЭС:

·         Руководство по оценке и контролю ДНК-реактивных (мутагенных) примесей в лекарственных средствах и установлению границ потенциального канцерогенного риска (рекомендация Коллегии Евразийской экономической комиссии от 6 августа 2019 года №23)

·         Решение Совета Евразийской экономической комиссии от 3 ноября 2016 г. № 89 "Об утверждении Правил проведения исследований биологических лекарственных средств Евразийского экономического союза"

·         ГОСТ Р 57130-2016 «Лекарственные средства для медицинского применения. Исследование генотоксичности и интерпретация полученных данных»

·         ГОСТ ISO 10993-3-2018 «Изделия медицинские. Оценка биологического действия медицинских изделий. Часть 3. Исследования генотоксичности, канцерогенности и токсического действия на репродуктивную функцию»